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2024-03-07 21:29:05

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深度解读肿瘤突变负荷(TMB) - 知乎

深度解读肿瘤突变负荷(TMB) - 知乎切换模式写文章登录/注册深度解读肿瘤突变负荷(TMB)心平气和海到无边天做岸,山登绝顶我为峰免疫检查点抑制剂(ICI)的疗效预测依旧缺乏确定的生物标志物。和 PD-L1 及微卫星不稳定(MSI)不同,肿瘤突变负荷(TMB)的获批引起了较多争议。中国《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识》已于近期发表,我们也来梳理一下这个免疫指标。什么是 TMB?TMB 是指特定基因组区域内体细胞非同义突变的个数,通常用每兆碱基多少个突变表示(mut/Mb),在早期研究中也直接以突变数量表示。TMB 可以间接反映肿瘤产生新抗原的能力和程度,预测多种肿瘤的免疫治疗疗效。目前免疫治疗最为确定的 3 个标志物——TMB,MSI 和 PD-L1 表达常有不同:同时具备 3 个标志物的患者比例仅为 0.6%。MSI-H 和 TMB-H 似乎具有一定的相关性,83% 的 MSI-H 患者同时为 TMB-H,而只有 16% 的 TMB-H 是 MSI-H。TMB 和 PD-L1 则相互独立,同时 TMB-H 和 PD-L1 阳性者对 ICI 反应最佳。TMB 的临床证据2014 年首次在黑色素瘤中发现了 TMB 和抗 CTLA-4 抗体的疗效具有相关性。2015 年,回顾接受帕博利珠单抗治疗的非小细胞肺癌(NSCLC)患者数据,发现具有更高 TMB 的患者具有持续临床获益和无进展生存期(PFS)改善。之后,几项大型的随机对照Ⅲ期研究也陆续证实了 TMB 的疗效预测作用:CheckMate 026 研究发现 TMB-H(≥ 243 突变)的患者中,纳武利尤单抗对比化疗具有 PFS(9.7 月 vs 5.8 月)和客观反应率(ORR)的改善(46.8% vs 28.3%)。CheckMate 227 研究发现对于 TMB ≥ 10 mut/Mb 的患者,双免疫对比化疗具有 PFS 的显著延长(7.2 月 vs 5.5 月)。基于以上结果,2018 年,NCCN 指南(2019.v1)首次将 TMB 列入 NSCLC 患者的免疫治疗疗效预测标志物。2017 年《新英格兰医学杂志》上一项荟萃分析发现在 27 种肿瘤中,TMB 和 ORR 具有显著相关性。在KEYNOTE-158研究中,包括肛管癌、胆管癌等 10 种肿瘤中发现,TMB-H(≥ 10 mut/Mb)的患者使用帕博利珠单抗比 TMB<10 mut/Mb 的患者具有更高的 ORR(29% vs 6%)。KEYNOTE-158 研究结果使得FDA 在 2020 年 6 月批准了帕博利珠单抗单药用于标准治疗后进展的晚期 TMB-H(≥ 10 mut/Mb)患者,FoundationOne CDx 为同时获批的伴随诊断,这标志着 TMB 正式成为继 MSI-H/错配修复缺陷(dMMR)后的第二个「泛癌种」免疫相关生物标志物。然而 TMB 并未受到一致认可。CheckMate 227研究更新总生存(OS)数据,发现 TMB 无法预测 OS 获益。KEYNOTE-021/189/407研究发现 TMB 和帕博利珠单抗+化疗的疗效不相关。就连获批的关键研究——KEYNOTE-158 中,TMB-H 和非 TMB-H 的患者的 PFS 和 OS 也没有显著差异。因此,TMB 的作用依旧难辨。血液 TMB(bTMB)POPLAR 和 OAK 研究的回顾性分析第一次发现了 bTMB 和组织 TMB(tTMB)的一致性,超过 1000 例接受阿替利珠单抗治疗的患者中,bTMB ≥ 16 mut/Mb 的患者具有更长的 PFS,且 bTMB 与 tTMB 具有相关性。一项基于 bTMB 的前瞻性 B-F1RST 研究显示,接受阿替利珠单抗治疗的 NSCLC 患者中 bTMB ≥ 16 mut/Mb 可预测 ORR 和 PFS 获益。然而 bTMB 也同样存在矛盾结果。度伐利尤单抗+tremelimumab 双免疫治疗中,NEPTUNE 研究发现 bTMB-H(≥ 20 mut/Mb)和临床获益无关,而 MYSTIC 研究中 bTMB ≥ 20 mut/Mb 的患者则具有更长的 OS 和 PFS。TMB 的影响因素TMB 可被很多因素影响,包括不同瘤种,内在遗传/分子因素,肿瘤微环境改变,外界致癌原,不同检测方法和不同界值都可能造成 TMB 缺乏异质性,而使之不能作为准确的反应预测因子(图 1)。TMB 在不同瘤种,生物特征和患者特征都有不同。最高见于皮肤鳞癌,黑色素瘤,NSCLC,最低见于乳头状甲状腺癌;吸烟患者 TMB 常较高;不同种族和性别中 TMB 也不同。MMR 通路基因突变、DNA 复制通路缺陷如 POLE/POLD 突变,以及 TP53,APOBEC,LRP1B,NF1,BRCA2 等基因突变和高 TMB 相关,而 EGFR,STK11,JAK1/2 和 B2M 等基因突变可能和更低的 TMB 相关。TMB 和拷贝数变异(CNV)也具有一定的相关性。TMB 检测的影响因素(图源:参考文献 6)TMB 的检测TMB 的检测受样本质量、检测方法和分析方法等多种因素影响,临床应用前应充分了解 TMB 检测的条件。样本:肿瘤纯度要求 ≥ 20%,需要有正常对照为检测提供胚系变异信息。方法:全外显子测序(WES)是 TMB 检测的「金标准」。但是 WES 价格昂贵,检测时间长,需要新鲜标本,因而应用受限。靶向测序 panel 已经成为 WES 的有效替代,为准确性考虑,其覆盖范围应 ≥ 1.0 Mb,测序深度 ≥ 500×。分析:TMB 的中位值和分布范围在不同癌种中有所不同,因此,在各个癌种中分别确定界值十分重要。应使用相同的筛选策略,选择排序在 20% 以上的病例定义为 TMB-H,而前瞻性的临床疗效才是确定 TMB 界值的最佳标准。不同靶向测序 panel 的 TMB 不能通用。小结对于无标准治疗的晚期肿瘤患者,TMB-H 提供了免疫治疗获益的可能。某些情况下 TMB 可预测 ICI 治疗反应,但结论并不一致,特别是 TMB 预测长期结局以及免疫联合治疗的疗效时应慎重。bTMB 和 tTMB 具有一致性,但临床应用还缺乏强证据。使用 TMB 时,应结合瘤种、人口特征、基因特征和检测方法综合解读。联合使用 PD-L1 和 TMB 等多种生物标志物可能是筛选免疫获益人群的更好方法。参考文献:1 肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020 年版). 中国癌症防治杂志. 2020, 12(5): 485-94.2 Yarchoan M et al. Tumor Mutational Burden and Response Rate to PD-1 Inhibition. N Engl J Med. 2017 Dec 21;377(25):2500-2501.3 Marabelle A et al. Association of tumour mutational burden with outcomes in patients with advanced solid tumours treated with pembrolizumab: prospective biomarker analysis of the multicohort, open-label, phase 2 KEYNOTE-158 study. Lancet Oncol. 2020 Oct;21(10):1353-1365.4 NCCN guideline: NSCLC (2019.v1)5 Li R et al. Choosing tumor mutational burden wisely for immunotherapy: A hard road to explore. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2020 Dec;1874(2):188420.6 Zhang Y et al. The emerging development of tumor mutational burden in patients with NSCLC. Future Oncol. 2020 Mar;16(9):469-481.文章原创:邵宜 肿瘤时间如有侵权,请联系删除发布于 2021-03-18 08:34​赞同 65​​3 条评论​分享​喜欢​收藏​申请

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产品简介:TMB(3,3′,5,5′-Tetramethylbenzidine)是辣根过氧化物酶(HRP)的常用显色底物之一。在HRP的催化下,TMB被H2O2氧化生成蓝色产物。主要吸收峰在370nm和652nm。在加入硫酸或者磷酸终止上述反应后,产物转变为黄色,最大吸收峰为450 m。传统的TMB显色试剂通常以AB液形式提供(TMB和H2O2溶液分到两管,使用前才可混合使用),并且容易产生沉淀,使用起来相对不方便,且容易导致操作误差。为克服以上缺点,我们采用最新的TMB显色技术,将所有相关试剂混合配成单一溶液,本产品具有以下特点:1、即开即用,操作简单,使用前无需做AB液混合的准备;检测灵敏度不低于AB液体系;2、仅由单一溶液组成,简化了操作步骤,也降低了操作误差,结果更加稳定;3、含有独特的稳定剂,保证溶液4℃下长期保存;4、相比于其他HRP酶显色底物(如ABTS和OPD)相比,检测灵敏度更高,而且本TMB溶液不含有DMF或DMSO等有机溶剂,安全无毒。本品为单一溶液形式且沉淀可溶型的TMB显色液,适用于ELISA检测,操作时只需加入200μl即用型的显色液,做简单孵育,加入ELISA终止液(BL1171A)或2M H2SO4终止反应后,即可用分光光度计在450nm处测定吸光度。本品可供完成约500个样品的检测。另外,本品也可用于血液或血红蛋白等样品中过氧化物酶量的检测。 使用方法:1、使用之前,取出适量TMB显色液,使其回到室温再开始使用。2、对于ELISA检测:参考ELISA 检测试剂盒的实验步骤,当加入HRP标记的抗体并孵育一段时间后,用适当洗涤液洗涤3-5次,每次3-5min。洗涤完毕后,去除洗涤液,加入200μl TMB显色液;对于在96孔板内进行的其他适当检测(如检测组织或细胞样品内源性过氧化物水平):直接在96孔板内加入10-20μl样品,之后加入200μl TMB显色液。3、室温避光孵育3-30min或更长时间(可长达24h),直至显色至预期深浅(此时反应液为蓝色)。4、加入50μl ELISA终止液(BL1171A)或2M H2SO4终止反应,溶液由蓝色转变为黄色,随后在450nm测定吸光度。或着在370nm或652nm测定吸光度。 常见问题:一、背景显色太深1、如果背景(没有样品的对照)显色太深,一方面需考虑使用适当的封闭液进行封闭,如商业化的封闭液或者商业化的和一抗相同来源的血清(5-10%)进行封闭。另一方面,直接使用经过适当亲和吸附的二抗,以减小二抗的非特异性交叉吸附。2、可以考虑缩短显色时间,或降低二抗浓度。另外,选择适当强度的洗涤液,或延长洗涤时间。3、可考虑TMB底物本身反应过于强烈。为了避免沉淀的产生,可在终止反应后马上读数,或者进一步稀释一抗和HRP结合物。二、没有显色或显色太弱1、适当提高一抗或二抗的浓度。检测二抗效果,滴一滴稀释二抗在离心管内,检测二抗是否被正常显色。2、可以使用更加灵敏的放大检测体系,例如使用生物素检测体系。3、可以适当延长显色时间。4、如果上述改进不能获得预期效果,可以考虑更换效果更好的一抗或ELISA。 注意事项:1、TMB对人体有刺激性,操作时请小心,并注意适当防护以避免直接接触人体或吸入体内。2、本产品为无色至微蓝色透明溶液,如果发现TMB显色液出现混浊或颜色变成较深的蓝色,应该停止使用。3、本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品。4、为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。 保存条件:4℃避光保存,有效期一年。

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BL728A

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TMB/H2O2显色的原理是什么呢? - 知乎

TMB/H2O2显色的原理是什么呢? - 知乎首页知乎知学堂发现等你来答​切换模式登录/注册物理学工作原理原理TMB/H2O2显色的原理是什么呢?有大神帮忙解释一下吗?是不是用的催化剂不同这原理会不一样呢?我看有的说是氧自由基,有的说是羟基自由基好奇怪呀,到底是哪一个?显示全部 ​关注者11被浏览97,729关注问题​写回答​邀请回答​好问题 6​添加评论​分享​4 个回答默认排序李伯伯要当红军喜欢弹吉他的药理学专业老二次元​ 关注原理如图Zhang X et. Rationale of 3,3',5,5'-Tetramethylbenzidine as the Chromogenic Substrate in Colorimetric Analysis. Anal Chem. 2020 Sep 15;92(18):12400-12406TMB与H2O2在生理pH下,由过氧化物酶催化发生第一步反应,TMB氨基失一个电子变为阳离子自由基,并在体系中以二聚电荷转移复合体(dimer charge-transfer complex)的形式存在,该二聚体在370nm和652nm有最大吸收,呈蓝色;在低pH下复合体会再次失去一个电子,并形成稳定的醌式共轭单体结构,在450nm处有最大吸收波长,呈黄色;下图是较早一篇文章对反应机理的解释Josephy PD. Oxidative activation of benzidine and its derivatives by peroxidases. Environ Health Perspect. 1985 Dec;64:171-8. 最后回答你的具体问题。从上图这篇文章综述的一些机制来看,其中无论是辣根过氧化物酶、高铁血红蛋白、还是葡萄糖氧化酶作为催化剂,都进行羟基自由基反应。所以催化剂应该不构成影响。由于我本人是偏生物方向的,化学知识比较有限,可能结论不一定正确,欢迎大佬指正。编辑于 2022-12-10 20:56​赞同 24​​4 条评论​分享​收藏​喜欢收起​好吃的丸子​ 关注我反应出来是绿色 救命啊哈哈哈哈哈发布于 2023-10-16 19:55​赞同 2​​8 条评论​分享​收藏​喜欢收起​​

关于TMB,史上最硬核科普在这里 - 知乎

关于TMB,史上最硬核科普在这里 - 知乎切换模式写文章登录/注册关于TMB,史上最硬核科普在这里迈杰转化医学伴随诊断整体解决方案领导者1.什么是TMB?肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)是指每百万碱基检测出的体细胞变异总数(mutations per Mb unit,muts/Mb)。但是关于TMB的精确定义,随着检测区域的大小、分布及包含变异的种类而变化【1】。2.为什么检测TMB?研究表明,肿瘤突变负荷高(tumor mutational burden high,TMB-H)的患者,更可能从免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitor,ICI)治疗中获益。如图1所示,对于TMB-H的肿瘤患者,其肿瘤细胞会表达大量的异常蛋白,这些异常的蛋白被呈递到肿瘤细胞表面后,可被免疫细胞识别,并激活免疫细胞对肿瘤的杀伤作用【2】。2020年6月,美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)加速审批Keytruda单药用于治疗TMB-H(TMB≥10 muts/Mb),既往治疗后疾病进展,且无满意替代治疗方案的晚期实体瘤患者。说明TMB作为泛癌种的免疫治疗生物标志物,其重要性得到FDA的认可。图1. 肿瘤新生抗原(tumour-specific neoantigens)识别示意图【2】3.如何计算TMB?关于TMB的计算,尚无行业标准。2017年Foundation Medicine发表了关于TMB的重磅文章:Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals thelandscape of tumor mutational burden,首次大规模分析了100,000例肿瘤样本的TMB检测数据。我们先看看FoundationOne CDx (F1CDx)是如何计算TMB的【3】:首先统计等位基因频率≥5%的同义和非同义突变过滤掉单核苷酸多态性数据库(Single Nucleotide Polymorphism database ,dbSNP)、外显子联盟(Exome Aggregation Consortium ,ExAC)中的胚系突变剩余的胚系突变使用体系-胚系/杂合算法(somatic-germline/zygosityalgorithm,SGZ algorithm )过滤然后过滤掉已知或潜在的驱动突变最后用剩余的突变数量除以检测的编码区大小(0.8 Mb)4.如何确定TMB cut-off?关于TMB cut-off的确定,尚无行业标准。我们再看看FoundationOne CDx (F1CDx)是如何确定TMB cut-off的:TMB cut-off =20 muts/Mb :2017年,FoundationOne分析了100,000例肿瘤样本的TMB,当HighTMB定义为≥20 muts/Mb时,20个癌种TMB阳性率>10%,38个癌种TMB阳性率>5%【4】TMB cut-off =10/13 muts/Mb :2020年,KEYNOTE-158研究中,使用FoundationOne CDx (F1CDx)分析了790例肿瘤样本的TMB,当High TMB定义为≥10muts/Mb,TMB阳性率为13%,当High TMB定义为≥13 muts/Mb,TMB阳性率为9%【5】5.迈杰转化医学的TMB检测方案?Med1CDx Panel是迈杰转化医学自主开发的一款大Panel检测产品,覆盖601个基因全外显子、38个基因融合相关内含子、29个基因52个化药分析位点、114个微卫星不稳定性分析位点,捕获区域大小为2.7 Mb。Med1CDx Panel检测TMB具有如下优势:TMB检测区域广:全面检测601个基因全外显子区域,非热点突变、罕见突变不漏检,TMB计算结果更准确 WES TMB相关性高:如图2所示,Med1CDx TMB与WES TMB线性相关性高达0.97,可完美替代WESTMB cut-off值设定科学:如图3所示,采用较为公认的四分位法确定TMB cut-off,即TMB值前25%的患者,更可能从免疫治疗中获益TMB cut-off值动态校正:根据每个样本的测序质量评估,仅计算满足生信分析质控标准区域的突变,保证结果准确图2. Med1CDx TMB与WES TMB线性相关性图3. Med1CDx在泛实体瘤(all)、结直肠癌(crc)、胃癌(gc)、肝癌(liver)、肺癌(lung)中使用四分位法确定的cut-off值6.为什么选择Med1CDx?Med1CDx采用全外显子区捕获设计,既解决了TMB计算准确性的问题,也解决非热点突变、罕见突变漏检的问题。如图4所示,Med1CDx的一项2979例泛实体瘤样本的回顾性数据分析表明,EGFR的突变出现在整个基因编码区域,其中多个突变位置是重要的转录后修饰位点,包括磷酸化、乙酰化、泛素化等,这是采用热点区捕获设计的产品无法做到的:图4. Med1CDx检测的2979例泛实体瘤样本的EGFR突变位点分布Med1CDx作为一款功能强大的检测产品,可解决创新药物研发痛点及患者用药痛点,如图5所示:图5. Med1CDx解决创新药物研发痛点及患者用药痛点原创:Heisenberg编辑:Grace参考文献:【1】Büttner R, et al.Implementing TMB measurement in clinical practice: considerations on assayrequirements. ESMO Open 2019;4:e000442. doi:10.1136/esmoopen-2018-000442.【2】Roman M. Chabanon,et al. Mutational Landscape and Sensitivity to Immune Checkpoint Blockers.Published OnlineFirst July 7, 2016; DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-16-0903.【3】PMA P190017/S014 FDA Summary of Safetyand Effectiveness:https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cdrh/cfdocs/cfpma/pma.cfm?id=P170019S016.【4】Roman M. Chabanon,et al. Mutational Landscape and Sensitivity to Immune Checkpoint Blockers.Published OnlineFirst July 7, 2016; DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-16-0903.【5】Zachary R. Chalmers , et al.Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutationalburden. Genome Medicine (2017) 9:34.DOI 10.1186/s13073-017-0424-2.【6】Fullprescribing information ofpembrolizumab(KEYTRUDA): https://www.fda.gov/drugs/resources-information-approved-drugs/pembrolizumab-keytruda.发布于 2021-09-08 10:56肿瘤肿瘤细胞癌症​赞同 10​​添加评论​分享​喜欢​收藏​申请

评估肿瘤免疫治疗疗效 | 肿瘤突变负荷(TMB)知多少?|突变|患者|肿瘤|检测|类型|-健康界

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评估肿瘤免疫治疗疗效 | 肿瘤突变负荷(TMB)知多少?

2022

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本研究分析了17种癌症类型的10,233名患者(80%未接受ICI治疗,20%接受ICI治疗),在ICI治疗之前/未进行,或在ICI治疗之后。

肿瘤突变负荷(tumormutationalburden,TMB)作为一个新兴的生物标志物,在预测肿瘤免疫治疗疗效中的作用越来越受到重视。TMB值在不同癌种中存在显著差异。目前TMB检测方法主要是基于高通量测序平台的全外显子测序和靶向Panel测序。为促进TMB检测和临床应用的统一认识及检测规范化,中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会分子病理协作组和肿瘤标志专业委员会遗传性肿瘤标志物协作组组织相关专家,综合国内外TMB检测和临床应用共识推荐、重要文献及临床实践,编写专家共识,对TMB检测的临床意义、检测过程中样本类型、检测方法、包含基因、生物信息学分析方法以及参考值设定等给出指导性建议。TMB的定义TMB一般是指特定区域内体细胞非同义突变的个数,通常用每兆碱基有多少个突变表示(XX个突变/Mb)。TMB评估受样本质量和数量、检测基因组大小、生信分析方法等多种因素影响,临床应用前应了解TMB的适用范围。不同检测方法获得的TMB应进行系统评估,判断是否具有可比性。TMB数值可反映肿瘤内产生肿瘤新抗原的潜力,与DNA修复缺陷密切相关,在多种肿瘤中dMMR和MSI-H患者具有较高的TMB。TMB的临床意义组织TMB( tTMB)是一个新兴的独立ICIs治疗疗效预测标志物,与多种肿瘤类型ICIs单药或两种ICIs联合治疗的疗效相关,已证实可作为泛癌种免疫治疗疗效的预测标志物。推荐既往标准治疗后疾病进展且没有更好替代疗法的实体瘤患者,尤其是高TMB的患者进行TMB检测,有助于扩大免疫治疗获益人群。中国人群TMB的独立预测价值仍需更多前瞻性研究验证。以下这篇关于TMB的研究文献,通过大队列样本探讨了TMB与免疫治疗预后的关联。

 期刊:Nature Genetics 影响因子:38.322

 研究流程图在多种癌症类型中,高肿瘤突变负荷(TMB)与免疫检查点抑制剂(ICI)治疗后的更长生存期相关。TMB与免疫治疗环境之外的生存之间的关联知之甚少。本研究分析了17种癌症类型的10,233名患者(80%未接受ICI治疗,20%接受ICI治疗),在ICI治疗之前/未进行,或在ICI治疗之后。在未接受ICI治疗的患者中,较高的TMB(癌症类型中较高的百分位数)与更好的预后无关;事实上在许多癌症类型中,较高的TMB患者的生存率更低,而ICI治疗的患者则相反,较高的TMB通常会有较长的生存期。该研究是更大队列接受ICI治疗的患者得到的数据,验证并扩展了先前的泛癌MSK-IMPACT数据,该数据显示高TMB与ICI后多种癌症类型的高生存率之间存在关联。非ICI治疗患者的比较数据表明,TMB与ICI后改善结果之间的这种关联不能归因于高TMB的一般积极预后作用。根据10,000多名患者在ICI治疗之前或之前分析的数据,高TMB似乎通常与许多癌症的生存率略低有关。

 队列中肿瘤突变负荷(TMB)与总生存期(OS)之间的关联附:肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)参考文献:ValeroC,LeeM,HoenD,etal.Theassociationbetweentumormutationalburdenandprognosisisdependentontreatmentcontext. NatGenet.2021;53(1):11-15.肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020 年版)部分内容来自伯豪生物,以上内容由医世象  夏日整编

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苯胺_百度百科 网页新闻贴吧知道网盘图片视频地图文库资讯采购百科百度首页登录注册进入词条全站搜索帮助首页秒懂百科特色百科知识专题加入百科百科团队权威合作下载百科APP个人中心收藏查看我的收藏0有用+10四甲基联苯胺播报讨论上传视频化学物质四甲基联苯胺,别名3,3',5,5'-四甲基联苯胺,是一种化学物质,化学式是C16H20N2。中文名四甲基联苯胺外文名Tetramethylbenzidine别    名3,3',5,5'-四甲基联苯胺化学式C16H20N2 [1]目录1简介2特性▪物理性质▪化学性质3应用简介播报编辑英文名称:Tetramethylbenzidine中文名称:3,3',5,5'-四甲基联苯胺中文同义词:TMB溶液;TMB游离酸;四甲基联苯二胺;TMB游离酸溶液;钡硫氰酸盐三水合物;四甲基联苯胺,TMB;A B双液 TMB显色液;四甲基联苯胺盐酸盐 二水;3,3',5,5'-四甲基联苯胺;3,3,5,5-四甲基联苯胺溶液CBNumber:CB6682185分子式:C16H20N2 [1]分子量:240.343 [1]特性播报编辑物理性质熔点 : 168-171 °C(lit.)沸点 : 168-171 °C密度 : 1储存条件 : 2-8°Cform : tablet水溶解性 : Slightly soluble. <0.1 g/100 mL at 20 ºC敏感性 : Light SensitiveBRN : 2808541稳定性: Stable, but moisture sensitive and may be light sensitive. Incompatible with water, strong oxidizing agents.化学性质3,3’,5,5’-四甲基联苯胺(3,3’,5,5’-Tetramethylbenzidine)即TMB是一种脂溶性较强的基团,因此容易进入细胞与细胞器中的HRP反应,且由于这种高度的脂溶性,使其易形成多聚体,在HRP活性部位产生粗大的、深蓝色沉淀物,这使得TMB成为组化实验中的一种很好的发色团。同时反应产物的沉淀,使得HRP的活性部位更加暴露,利于酶氧化反应进行。应用播报编辑TMB的反应产物为深蓝色,利于光镜观察,且反应产物越聚越大,常超出单个细胞器的范围(而DAB则被限制在其内),故TMB反应的检测阈较低。由于上述优点,目前TMB常用于光镜及超微结构水平的HRP及HRP-WGA神经投射的研究。需要注意的是:TMB显色液中的A液和B液应在2h内新鲜配制。另外,TMB是一种较强的皮肤刺激剂,并有致癌的潜在可能,故使用时应带手套及在通风条件下操作。TMB经HRP作用后共产物显蓝色,目视对比鲜明。TMB性质较稳定,可配成溶液试剂,只需与H2O2溶液混和即成应用液,可直接作底物使用。另外,TMB又有无致癌性等优点,因此在ELISA中应用日趋广泛。酶反应用HCL或H2SO4终止后,TMB产物由蓝色呈黄色,可在比色计中定量,最适吸收波长为450nm。ABTS虽不如OPD和TMB敏感,但空白值极低,也为一些试剂盒所采用新手上路成长任务编辑入门编辑规则本人编辑我有疑问内容质疑在线客服官方贴吧意见反馈投诉建议举报不良信息未通过词条申诉投诉侵权信息封禁查询与解封©2024 Baidu 使用百度前必读 | 百科协议 | 隐私政策 | 百度百科合作平台 | 京ICP证030173号 京公网安备110000020000

中国TMB标准化项目第一阶段成果重磅发布-健康界

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中国TMB标准化项目第一阶段成果重磅发布

2021

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TMB是备受关注的生物标志物,但其预测价值尚未形成共识。

中国TMB标准化项目第一阶段成果重磅发布

2021年8月28日,在国家癌症中心肿瘤病理诊断新进展研讨会暨第七届中美肿瘤诊断病理论坛期间,中国TMB标准化项目第一阶段成果正式发布。发布会上,由项目组各位专家汇报了第一阶段的工作成果介绍了成果蓝皮书的内容框架。发布会由国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院病理科主任应建明教授主持,并特邀中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会第四届主任委员步宏教授、第五届主任委员杜祥教授、国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院河北医院院长李宁教授以及中国食品药品检定研究院非传染病诊断试剂室主任黄杰教授分别为本次成果发布会致辞。中国医学科学院肿瘤医院病理科主任应建明教授主持线上会议步宏教授提到:“TMB是备受关注的生物标志物,但其预测价值尚未形成共识,究其原因,可能与检测的标准和规范不统一有关。中国TMB标准化项目是很好的探索,所有参与单位的合作共赢是项目的基本宗旨。”杜祥教授表示:“这是一个跨系统、跨领域、参与单位非常多的项目,非常不容易,祝贺项目有很好的进展,如果未来可以形成国家标准,对未来的临床工作会有更大的促进作用。”李宁教授对项目做出高度评价:“国家癌症中心的使命是提高中国肿瘤的诊断和治疗的标准化和规范化水平,TMB项目契合了我们这两个使命。把标准制订好,就可以基于TMB检测做好相应的诊疗,具有引领性的价值和意义!”黄杰教授表示:“这是第一次中检院和临床机构合作来推动生物标志物的检测标准化及质量控制,跟病理行业合作也是首次。希望以此为契机,后期在临床应用的肿瘤检测标准化工作中有更多的合作。”会议开始,复旦大学石乐明教授带来了题为《NGS标准化研究国际进展》的报告,向大家介绍了美国FDA于2004年发起的MAQC计划, 着重介绍了关于肿瘤NGS检测标准化方面的内容与成果,让听众全面了解肿瘤NGS检测标准化研究的国际趋势和重要进展。复旦大学石乐明教授做报告《NGS标准化研究国际进展》应建明教授做了题为《中国TMB标准化项目第一阶段总体结果(1A-1B)及1C计划》的报告,回顾了项目的整体目标以及自去年10月18日启动会以来的项目历程。报告重点发布了对各参与单位在点突变探测准确度和TMB检测能力的评估结果,着重分析了对TMB检测产生影响的诸多因素,其中样本的肿瘤细胞纯度是在诸多影响因素中权重最大的,应教授强调在NGS检测前对样本进行病理质控和肿瘤纯度的确定是非常必要的。在报告的结尾,他提醒所有的参与单位:TMB项目马上进入更为关键的临床样品测序(1C)阶段,并介绍了该阶段的主要目标和计划。中国医学科学院肿瘤医院应建明教授做报告《第一阶段总体结果(1A-1B)及1C计划》应教授提到:项目1B阶段结束后,项目组评估了各参与单位的质控性能、位点检出性能,以及TMB计算能力,建立了可复用的肿瘤NGS 大panel评估体系,并将成果编辑整理形成《中国TMB标准化项目第一阶段成果蓝皮书》。今天发布的1A-1B的结果已经写入了蓝皮书,在审校之后将在年底的国家癌症中心年会上正式跟大家见面。《中国TMB标准化项目第一阶段成果蓝皮书》黄杰教授做了题为《中国TMB标准化项目第一阶段:中检院参考品分析结果(1B)》的报告。报告中重点发布了各单位运用其大Panel检测产品对参考品进行测序后,各种质量评估结果及TMB检测相关性的评估结果,并通过分析总结出中国大Panel产品的设计特点及可能给TMB检测带来的影响。黄教授还介绍了目前TMB标准化项目中构建的参考品及相关评估体系:包括1)参考细胞系、 2)通过NGS生成的高深度WES数据集、 3)通过生信方法分析得到的高可信的点突变数据库及相应的TMB标准值 、4)正在搭建的可复用的数据分析和评估平台(抗癌登月:https://www.0cancer.cn/tmbnews/public/)。中国食品药品检定研究院黄杰教授做报告《中检院参考品分析结果(1B)》     专家寄语:中国抗癌协会肿瘤病理专委会主任委员  刘艳辉教授:很高兴见证蓝皮书中重要结果的发布!国外的LDT法规和监管框架比较成熟,陆续开展了涵盖TMB评估的肿瘤NGS大panel检测,而我们还处于逐步完善阶段,本项目的目标,就是建立评估TMB大panel标准化检测流程和评估体系,中国抗癌协会肿瘤病理专委会对项目寄予厚望并大力支持,相信在专家组的指导和业界同仁通力合作支持下,一定会产生丰硕的成果。中国食品药品检定研究院非传染病诊断试剂室主任  黄杰教授:第一次和临床机构一起参与这么大规模的标准化项目。在这个过程中,我看到了临床机构及产业界对标准化的需求:从多靶标联合检测及多组学联合检测层面看,产品设计开发、监管落地、最终产品的实际应用、质量管理等整个链条的标准化操作流程,需要有更多的关于标准化制定的工作,呼吁大家积极参与和支持!复旦大学附属肿瘤医院病理科副主任  周晓燕教授:很高兴今天看到了既翔实又直观的成果,真切了解到了TMB检测的受控因素,对于后续临床样本的回顾性及前瞻性临床药物的使用、cut-off值的制定,都是非常重要的基础。这项工作对于其他标志物的规范也是一个借鉴,比如HRD等。这是一个多中心、多学科、跨领域合作的项目模式,可以得到更为重要的结果。西安交通大学、青年千人计划学者  叶凯教授:非常高兴可以把相关知识和技能应用在临床检测的标准化工作中,后续还有很多工作要做,比如在不同纯度下TMB的计算,我们需要纳入更多的参数,运用更好的计算手段,前面的几轮计算会不断的迭代、优化,使得更加贴近临床,切实的让临床检测变得标准化,服务于患者。期待我们一起做出自己的贡献!北京大学生命科学学院、统计科学中心、生物信息中心研究员  李程博士:就项目而言,这是一个长期的、任重道远的事情,不是一个短期完成的工作。TMB应用到临床还需要有长期的跟踪和预后的关联,可能是需要至少5年的评估的。项目的许多分析工作都是志诺维思在做,如果把更多的国内生物信息的同行吸引进来,对整个项目是有帮助的。广东省肺癌研究所所长 张绪超教授:TMB检测在美国已经有验证,并且已经有LDT项目在FDA获批了,我们如何在国际上做到可信可靠,具有一定的挑战性。我们看到了初步的数据结果,跟MAQC的结果有非常类似的地方,性能表现是非常符合规律的。希望项目能够产生一套可用标准,对于国家管理机构、临床单位来说,都是能服务于患者的好事。志诺维思(北京)基因科技有限公司创始人&CEO  凌少平博士:志诺维思作为项目唯一的独立的数据分析和技术支持单位,深感责任重大。在大概6个多月的时间内,总共处理了约30T的数据,从标准集的建立到后续的分析,我们严格按照工作组专家指导意见进行。这种标志物的应用评估及标准建立,是国家精准医学发展所需,我们希望与大家一道把项目继续推动下去。注:中国TMB标准化项目(China TMB Harmonization Project)于2020年10月18日,由国家癌症中心、中国食品药品检定研究院与中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会共同发起,是一项由临床医生发起,旨在完成TMB临床验证获得临床证据并推动临床应用的标准化研究项目。项目拟通过对TMB在肿瘤免疫治疗临床应用中所涉及的相关问题进行全面考察和分析,完成对不同基因检测产品的分析和评估工作;建立TMB计算方法在不同类型检测方法与全外显子组(WES)之间的转换关系;应用临床试验样本,结合随访数据,划定不同癌种免疫治疗的TMB最佳获益基线,建立TMB临床检测标准及评估体系。项目在方案流程上,参考了FoCR及QuIP的项目积累的经验,同时根据中国临床检测的实际情况进行了大量的优化调整。项目总共分为两个阶段,第一阶段是中国TMB检测现状调研与能力评估,第二阶段是各癌种TMB临床获益评估与基线建立。

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浅谈TMB(一)----TMB在肿瘤免疫治疗中有什么地位? - 知乎

浅谈TMB(一)----TMB在肿瘤免疫治疗中有什么地位? - 知乎首发于浅谈基因检测行业切换模式写文章登录/注册浅谈TMB(一)----TMB在肿瘤免疫治疗中有什么地位?波比基因检测/医药行业/精准医疗;健康管理,癌症早筛咨询。我们为什么要谈论TMB?TMB是肿瘤突变负荷的英文缩写,是判断肿瘤患者是否适合进行免疫治疗的一类分子标记。已有多项临床研究证实,高TMB肿瘤患者接受免疫检查点抑制剂治疗后的临床获益率较高,包括黑色素瘤抗CTLA-4治疗[PMID:25409260]、尿路上皮癌抗 PD-L1治疗[PMID:26952546]、非小细胞肺癌和结直肠癌抗 PD-1 治疗[PMID:25765070;26028255],可能与这些肿瘤中免疫反应性新生抗原的高表达有关[PMID:25765070]。所以目前临床上想要采取免疫治疗策略时,都会先进行TMB,PD-L1,MSI的检测。什么是TMB?肿瘤突变负荷(TMB,Tumor Mutation Burden)的定义为每百万碱基中被检测出的,体细胞基因编码错误、碱基替换、插入或缺失错误的总数。简单理解就是肿瘤发生非同义突变的频率。TMB如何进行检测?NCCN最新指南已经推荐在非小细胞肺癌中,可进行TMB的检测,筛选适合接受纳武利尤单抗(Nivolumab)+伊匹单抗(Ipilimumab)联合治疗,或纳武利尤单抗单药治疗的肺癌患者。但是对于如何检测TMB并没有共识。目前全外显子组测序(WES,whole exome sequencing)是行业内公认的TMB检测金标准。但市场价格普遍在1.5万到2万,考虑到经济成本。市场上大多数大panel常作为TMB检测的替代方案。比较有名的大panel是2017年底在美国获批的Foundation One CDx(324基因)和MSK-IMPACT (468基因),被证实能达到与WES高度的相关性。然而,这种高度相关性只是针对某一癌种而言的。不同癌种的TMB相差很大,一个Panel不能适用于所有癌种。事实上,用单一大Panel计算的TMB与全外显计算的TMB相关性,在不同癌种中显示出了巨大的差异。传统的检测技术是通过采取患者的肿瘤组织(tTMB)来分析患者的TMB。目前可以通过血液TMB(bTMB)检测,而且相比于组织检测,血液检测更加方便、快捷,同时非侵入式的操作方式也避免了患者遭受更多的痛苦。TMB结果如何解读?1,看cut-off值。cut-off即临界值。在TMB结果解读中,称为最佳获益人群的临界阈值。TMB的 cut-off值目前暂时没有一个统一的标准,业内公认的几个cut-off值为10,12,16。高于这个值即为高TMB。高TMB被认为可以从免疫治疗中获益,可尝试进行免疫疗法。附:OS(overall survival) 总生存 从随机化开始至(因任何原因)死亡的时间。OS 被认为是肿瘤临床试验中最佳的疗效终点,当患者的生存期能充分评估时,它是首选终点。最大的优点是记录方便,无论是院内还是院外,确定患者死亡的日期基本上没有困难。如果研究结果显示生存有小幅度提高,就可认为是有意义的直接临床获益证据。缺点也是有的,大型试验随访期较长。临床试验中常常会用到 5 年生存率,即——某种肿瘤经过各种综合治疗后,生存五年以上的患者比例。肿瘤患者治疗后,一部分复发转移、一部分死亡,一部分生存。80% 复发转移常发生在根治术后 3 年内,10% 左右发生在 5 年内,5 年后再次复发概率很低。因此以 5 年为节点,这是有一定科学性的。ORR(objective response rate)客观缓解率肿瘤体积缩小达到预先规定值并能维持最低时限要求的患者比例,为完全缓解和部分缓解比例之和。缓解期通常是指从开始出现疗效直至证实出现肿瘤进展的这段时间。ORR 是一种直接衡量药物抗肿瘤活性的指标,在单臂试验中进行评价。ORR 的缓解标准应在试验开始前的方案中提前定义,评估内容包括缓解程度、缓解持续时间以及完全缓解率(没有可测量到的肿瘤),不包括疾病稳定——肿瘤缩小是直接疗效,疾病稳定是疾病的自然进程。PFS(progression-free survival) 无进展生存期从随机化开始到肿瘤发生(任何方面)进展或(因任何原因)死亡之间的时间。与 OS 相比,增加了「发生恶化」这一节点,而「发生恶化」往往早于死亡,所以 PFS 常常短于 OS,却也能在 OS 之前被评价,因而随访时间短一些。PFS 的改善包括了「未恶化」和「未死亡」,即间接和直接地反映了临床获益,它取决于新治疗与现治疗的疗效/风险。而正因为增加了「发生恶化」这一节点,而不同肿瘤进展的定义不同,不同研究在判断肿瘤进展时容易产生偏倚。因此,在临床试验设计中,「肿瘤进展」的标准必须要进行明确的定义,还包括 PFS 的评估、观察、分析方法,随访和影像学评价必须是均衡的,最好有一个由影像学专家和临床专家组成的处于盲态的独立裁定小组进行。PFS 包括死亡,更好地反映了药物毒副作用,因此与 OS 有更好的相关性。然而,如果评估 PFS 的过程中,发现大部分患者不是死于肿瘤,而是其他疾病,这时势必 PFS 会有很大偏倚。此时就不得不说与 PFS 类似的另一个评估指标——TTP。知识点来源于网络,如有侵权及错误请联系本人。发布于 2020-01-31 16:47癌症免疫疗法肿瘤细胞免疫治疗​赞同 12​​3 条评论​分享​喜欢​收藏​申请转载​文章被以下专栏收录浅谈基因检

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